以前農業社會，人們的排泄物《水肥》是很重要的肥料來源，為了取得「比較肥」的水肥，必需定期將水肥挑出來，水肥若在化糞池裡待太久，就會慢慢被池裡頭的微生物給分解！因水肥是由有機質組成，所以自古以來就是微生物非常喜歡的食物。
現今已無人使用水肥澆肥了，為什麼水肥車卻大街小巷到處抽水肥呢？因為現在的化糞池已喪失分解功能，所以化糞池很容易就會堆積水肥，故需經常性抽水肥。
農業社會的化糞池為何可以分解糞便，高科技的現在卻不會化糞了呢？我們在設計時，考量的是舒適清爽，卻忘了也要給化糞池內的微生物留一個繁衍的環境，有幾個被忽略的細節，造成微生物死亡，導致化糞池罷工「不」化糞的原因
化糞池本身含有大量的微生物菌群，微生物可自然分解水肥的作用，然而現今生活習慣的改變，化學藥劑大量使用，清洗馬桶，至微生物菌種於化糞池內無法繁衍，化糞池效能明顯降低；再者，受限於化糞池槽體空間不足，至微生物的增長速度緩慢，無法於短期內分解水肥，至水肥固化物不斷的堆積，易產生沼氣，也容易將連通管組塞，常導至化糞池淹水困擾，而當菌種數量與水肥產生量不成比例時，也會喪失分解功能，此時就需定期抽取化糞池，方能減緩化糞池的負擔，更能將槽體空間清空，化糞池效能也可再次提升。
生存環境的改變
「化糞池」是靠池內豐富的微生物菌種來分解糞便，我們卻使用大量強酸、強鹼、消毒水、清潔劑等化學藥劑來清潔廁所，這些藥劑排入化糞池後，細菌便會被高度抑制，尤其若濃度太高時，微生物菌甚至會被消滅，缺乏活菌的化糞池就只是一個大容器，喪失化糞功能，此時不但化糞池將快速累積「水肥」，造成抽水肥的次數大幅增加，並相繼引發排水管及化糞池等後續問題。
停留時間過短暫
一般微生物可分為好氧型、厭氧型及兼氣型三類，好氧微生物需在有氧氣環境下才能生存；厭氧微生物，容不下氧氣，只要接觸到氧氣，微生物菌種即會被消滅；而兼氣微生物，不論在好氧或缺氧環境，他們都可以自在生存。化糞池為缺氧環境，所以池內的微生物主要為厭氧微生物。農業時代因人口少，土地面積大，所以池內細菌有足夠時間可以繁殖。但現代社區大樓卻是住戶太多，化糞池槽體卻太小了，太短的停留時間將大大衝擊厭氧菌的繁殖速度。
油脂混合水肥
以前，化糞池只有糞便會排入，後來建築法規的修訂，要求新蓋的建築物，廁所及廚房污水都排入化糞池做厭氣處理（『污水處理設施』的攔汙除油槽），依序經過好氣、沉澱及消毒、放流等處理；原本化糞池仍可分解水肥，但廚房污水排入化糞池，油脂讓微生物消滅，因為廚房污水含有油脂，而油脂對微生物來說是剋星，因為油脂不但會包裹微生物造成缺氧及阻礙營養輸送，且油脂更會攻擊微生物，造成菌種大量死亡，化糞池從此不再化糞了。
油脂排入化糞池，造成菌種大量死亡，時間久了，油脂及水肥會相互結合成硬化，最後若連水肥車都無法抽除時，則需改由人工挖除，費用相當驚人！